合肥和南京是中国安徽省和江苏省两个重要的城市。就房价而言，根据最新数据和市场趋势，南京的房价相对较高。

南京作为江苏省的省会城市，具有强大的经济实力和发展潜力，吸引了大量的人口和投资。南京拥有较为完善的城市基础设施和优质的公共服务，同时也是教育、科技、金融等领域的重要中心。这些因素使得南京成为了一个繁荣的城市，房地产市场供需矛盾突出，房价持续上涨。尤其是南京的核心区域，如鼓楼、玄武、秦淮等地，房价较高，甚至达到了国内一线城市的水平。

合肥作为安徽省的省会城市，也是一个快速发展的城市。合肥在科技、制造业等领域取得了不俗的成就，吸引了一大批人口和企业。然而，相较于南京，合肥的房地产市场相对较为平稳。合肥的房价相对较低，尤其是一些新兴的城市区域，如蜀山、包河等，房价相对较为亲民。

总体而言，南京的房价相对较高，因为其经济实力和发展潜力较强，吸引了大量投资和人口。合肥的房价相对较低，尽管也在快速发展，但相对南京而言还有一定的差距。当然，房价的具体情况也会受到各种因素的影响，包括地理位置、楼盘品质、市场供求关系等等。因此，在购房时还需具体考虑个人需求和经济能力。