第三方支付公司通过以下几种方式盈利：

1. 交易手续费：第三方支付公司通常会从每笔交易中收取一定的手续费。这个手续费通常是按照交易金额的一定比例收取的，或者是固定的费用。这个手续费是支付公司的主要收入来源之一。

2. 资金存管：第三方支付公司通常会提供资金存管服务，将用户的资金存放在其指定的银行账户中，同时为用户提供支付、转账、提现等服务。第三方支付公司可以通过与银行的合作，获得存管资金的利息差额收入。

3. 金融产品销售：一些第三方支付公司还会推出各种金融产品，如余额宝、理财产品等，通过销售这些金融产品来获得收入。这些金融产品通常会投资于低风险的债券、货币市场工具等，从中获取收益，并与用户分享一部分收益。

4. 跨境支付服务：随着全球贸易的增加，跨境支付需求也逐渐增加。一些第三方支付公司提供跨境支付服务，帮助商家和个人进行国际间的支付和结算。这些支付公司可以通过收取一定的跨境支付手续费来盈利。

5. 数据分析和营销服务：第三方支付公司可以通过分析用户的支付数据，提供相关的数据分析和营销服务给商家。商家可以根据用户的支付行为和消费习惯进行精准的广告投放和营销活动，从中获取收入。

需要注意的是，第三方支付公司的盈利模式可能因公司的规模、地区、产品定位等因素而有所差异。以上仅是一些常见的盈利方式，具体情况还需根据具体公司来分析。